Een ander onverwacht voordeel van de methoden van de uitvinding is de extreme gevoeligheid die kan worden vastgesteld uit verschillende soorten monsters, waaronder het gebruik van een enkel wattenstaafje, een gemengd cultuurmonster of een bacterieel isolaat. In tegenstelling tot andere methoden die in de techniek bekend zijn, zijn de methoden van de uitvinding in staat om minder dan 210 CFU / monster (en in sommige gevallen minder dan 15 CFU / monster) te detecteren zonder de noodzaak om het monster te kweken. (Zie figuur 2).
De patiënt wordt verdacht van of loopt een hoog risico op het hebben van een multiresistente bacteriekolonisatie of infectie. Patiënten met een hoog risico omvatten, maar zijn niet beperkt tot, patiënten die wonen in of worden opgenomen in een instelling voor langdurige zorg, patiënten die zijn opgenomen op de intensive care-afdelingen (ICU's), immuungecompromitteerde patiënten, patiënten die worden behandeld voor kanker of die chemotherapie ondergaan, orgaan- en beenmergtransplantatiepatiënten, patiënten met beademingsapparatuur of katheters, patiënten ter voorbereiding op chirurgische ingrepen, postoperatieve patiënten, patiënten die eerder gediagnosticeerd of behandeld zijn voor een gezondheidszorggerelateerde infectie (HAI) en anderen. Een patiënt met een hoog risico is bijvoorbeeld neutropenisch, heeft kanker of heeft een transplantatie ondergaan. In sommige aspecten is de patiënt "asymptomatisch", wat betekent dat hij niet de traditionele tekenen en symptomen vertoont.
Het monster is elk biologisch monster dat gramnegatieve of grampositieve bacteriën bevat. Het biologische monster is bijvoorbeeld een anale uitstrijkje, een rectaal uitstrijkje, een huiduitstrijkje, neusuitstrijkje, wonduitstrijkje, ontlasting, bloed, plasma, serum, urine, sputum, ademhalingsspoeling, cerebrospinale vloeistof of kweekisolaat.
Zodra het bacteriële DNA uit het biologische monster is geëxtraheerd, wordt een verrijkingsstap uitgevoerd voorafgaand aan de detectie van de MDRO-geassocieerde genen. Verrijking wordt bijvoorbeeld bereikt door multiplex PCR uit te voeren. Na verrijking wordt detectie bijvoorbeeld uitgevoerd met behulp van real-time PCR met primers die specifiek zijn voor het met MDRO geassocieerde gen dat wordt gedetecteerd. Optioneel wordt een interne amplificatiecontrole opgenomen om te waken tegen valse negatieven die verband houden met PCR-remming. Bovendien worden bij elke prestatierun van de assay passende monsters van positieve, negatieve en controle zonder sjabloon (NTC) meegenomen.